Guerra-Meza et al., 2025 de
Artículo Científico
Especies de Ramalina, Dirinaria y Lecanora en la playa “El Maviri”: Un primer reporte
Guerra-Meza Omar1, Garrido-Palazuelos Lennin I.2, Mora-Romero Guadalupe Arlene3, Félix-Gastélum Rubén1, Leyva-Madrigal Karla Y.3, Sánchez-Parra Luis R.3
1Universidad Autónoma de Occidente (UAdeO), Unidad Regional Los Mochis. Departamento Académico de Ciencias Naturales y Exactas. Blvd. Macario Gaxiola y Carretera Internacional, México 15, C.P. 81223, Los Mochis, Sinaloa, México.
2UAdeO, Unidad Regional Los Mochis. Departamento Académico de Ciencias de la Salud. Blvd. Macario Gaxiola y Carretera Internacional, México 15, C.P. 81223, Los Mochis, Sinaloa, México.
3UAdeO, Unidad de Investigación en Ambiente y Salud. Blvd. Macario Gaxiola y Carretera Internacional, México 15, C.P. 81223, Los Mochis, Sinaloa, México.
Correspondencia: arlene.mora@uadeo.mx
Área Temática: Ciencias Ambientales Recibido: 24 noviembre, 2024 Aceptado: 15 enero, 2025 Publicado: 28 enero de 2025 Cita: Guerra-Meza O, Garrido-Palazuelos LI, Mora-Romero GA, et al. 2025. Especies de Ramalina, Dirinaria y Lecanora en la playa “El Maviri”: Un primer reporte. Bioc Scientia 1(1). https://doi.org/10.63622/RBS.2401 Copyright: © 2025 by the authors. Submitted for possible open access publication under the terms and conditions of the Creative Commons Attribution (CC BY-NC) license(https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/). |
Resumen: Los líquenes son asociaciones simbióticas mutualistas entre hongos y microalgas o cianobacterias que pueden prosperar en un amplio margen de ecosistemas, incluyendo aquellos con condiciones desérticas o altitudes elevadas. Debido a su sensibilidad a contaminantes atmosféricos y a su capacidad para absorber y retener elementos metálicos, éstos han sido utilizados como bioindicadores de la salud ecosistémica. A pesar de su relevancia ecológica, existe poca información respecto a la diversidad de líquenes en ciertas regiones de México, como el estado de Sinaloa. En este estudio se realizó un muestreo dirigido en la playa “El Maviri”, ubicado en el municipio de Ahome, Sinaloa, en el que se obtuvieron cinco morfotipos de líquenes. Para su identificación, se extrajo su ADN mediante el método CTAB, se amplificó la región ITS y se realizó un análisis filogenético mediante el método de Máxima Verosimilitud. En el análisis, tres muestras se identificaron como Ramalina sp., dos de ellas formaron un clado hermano a R. complanata y una a R. stenospora. Por otra parte, una muestra se identificó como Dirinaria consimilis, mientras que la última muestra se identificó como Lecanora sp., misma que formó un clado cercano a L. argopholis. Estos resultados enfatizan la importancia de la playa “El Maviri” como un hábitat para la diversidad de líquenes, sin embargo, se necesitan más estudios para explorar los roles ecológicos de estas especies, así como evaluar su potencial para fines médicos o biotecnológicos.
Palabras clave: Liquen, identificación molecular, Ramalina, Dirinaria, Lecanora
Abstract: Lichenized fungi are a part of lichen symbiotic associations, in which a fungus and a microalgae or cyanobacteria form a mutually beneficial relationship. This relationship allows lichenized fungi to thrive in a wide range of environments, including extreme conditions such as deserts and high altitudes. Due to their sensibility to atmospheric pollutants and their ability to absorb and retain metallic elements, they have been used as bioindicators of the ecosistem health. Despite their ecological significance, little is known about the species diversity of lichenized fungi in certain regions of México, such as the state of Sinaloa. In this study, a directed sampling was performed in “El Maviri” beach, located in the municipality of Ahome, Sinaloa, in which five lichen morphotypes were obtained. For their identification, their DNA was extracted through the CTAB method, the ITS region was amplified and a phylogenetic analysis was performed using the Maximum Likelihood method. In the analysis, three samples were identified as Ramalina sp., where two of them formed a sister clade with R. complanata and one with R. stenospora. On the other hand, one sample was identified as Dirinaria consimilis, while the last sample was identified as Lecanora sp., which formed a sister clade with L. argopholis. These findings emphasize the importance of “El Maviri” beach as a habitat for lichen diversity. Further studies should be conducted to explore the potential ecological roles of these lichen species and to assess their potential for medicinal or other practical uses.
Keywords: Lichenized fungi, molecular identification, Ramalina, Dirinaria, Lecanora.
Los líquenes se definen como sistemas simbióticos autosustentables derivados de la interacción mutualista entre hongos y algas, conocidos como micobiontes y fotobiontes, respectivamente (Muggia y Grube, 2018). También, se describen como ecosistemas complejos que son hospederos de múltiples microorganismos, tales como bacterias, algas verdes, diatomeas, cianobacterias y otros hongos liquenizados asociados como parásitos, saprófitos o comensales (Cardinale et al., 2008; Lawrey y Diederich, 2003; Moya et al., 2017; Zachariah y Varghese, 2018).
Esta diversidad microbiana influye en la condición y la función de las comunidades de líquenes. Por ejemplo, las microalgas y cianobacterias contribuyen a la actividad fotosintética de líquenes, que les provee de energía a través de la producción de carbohidratos (Grimm et al., 2021). Por otra parte, las diatomeas contribuyen a su integridad estructural de los líquenes a través de la formación de corazas silíceas que protegen al organismo del estrés ambiental (Brochhardt et al., 2017). Por otra parte, algunos hongos liquenizados pueden actuar como parásitos, alimentándose de los nutrientes y los recursos de los líquenes, ocasionando su debilitamiento y su muerte potencial. Sin embargo, otros hongos presentan una relación simbiótica mutualista. Esta interacción es fundamental para la supervivencia de muchos líquenes, ya que les permite adaptarse a diferentes condiciones ambientales y aumentar su capacidad de colonización (Lawrey y Diederich, 2003). El hongo aporta nutrientes adicionales, ayudándolo a crecer y reproducirse de manera más eficiente. Además, puede proteger al liquen de posibles depredadores o patógenos, lo que aumenta su longevidad y su capacidad de dispersión (Grube, 2010; Magyar et al., 2016). La relación simbiótica entre ciertos hongos y los líquenes es esencial para mantener el equilibrio ecológico en los ecosistemas donde habitan.
Estos organismos son un grupo cosmopolita que pueden encontrarse en diferentes microhábitats y microclimas dependiendo del taxón o grupo de taxones a los que pertenecen (Galloway, 1992). Los líquenes son considerados extremistas debido a su habilidad para crecer en ambientes extremos, así como desiertos secos, cálidos y fríos (Herrera-Campos et al., 2014; Knudsen et al., 2017). Algunos hongos liquenizados prefieren habitar líquenes de regiones árticas, en donde lo protegen de las temperaturas frías extremas (Etayo et al., 2023). Otros se desarrollan en bosques tropicales, donde contribuyen a la retención de la humedad y previenen la desecación del liquen (Lücking, 1999). Además, pueden crecer en diferentes sustratos como rocas, costras del suelo, detritus, corteza de árboles o arbustos e, incluso, cemento, plástico y vidrio; también, presentan distintos tipos de crecimiento, como incrustante, el folioso y el fruticoso, las cuales son las formas más prevalentes (Shukla et al., 2013). Por consiguiente, los hábitats en los que los líquenes se encuentran influencian su morfología, permitiendo la formación de diferentes estructuras, tamaños y colores (Hawksworth, 1988).
Adicionalmente a su adaptabilidad y sus beneficios ecológicos, se ha observado que los líquenes presentan una relación con la calidad del aire. Debido a su sensibilidad a contaminantes industriales y atmosféricos, así como a su habilidad para acumular metales y otros contaminantes en su talo, los líquenes han sido utilizados como biondicadores para evaluar la salud ecosistémica y el impacto de las actividades antropogénicas en el ambiente (Bergamini et al., 2005; McCune et al., 2018; Benítez et al., 2019). Sin embargo, distintas especies de líquenes han mostrado capacidades diferentes para absorber o tolerar contaminantes (Asplund y Wardle, 2016). Esto resalta la importancia de su identificación, convirtiéndose en un paso esencial previo al uso de estos organismos para monitorear un área.
A nivel mundial, se estima que se han descrito más de 20,000 especies de líquenes (Hawksworth y Lücking, 2017). En México, la investigación sobre la diversidad de líquenes se encuentra en crecimiento y se estima que existen alrededor de 2,833 taxa, que incluyen 2,722 especies y 111 categorías infraespecíficas, siendo el grupo de los ascomicetes más diverso en comparación con el de los basidiomicetes (Herrera-Campos et al., 2014). Actualmente, existe poca información respecto a las especies de líquenes presentes en Sinaloa y no existen estudios extensos en donde se estime su diversidad y distribución (Ponce de León, 1908; Culberson, 2002). Esta falta de conocimiento representa una barrera para el entendimiento de la biodiversidad de líquenes en la región. Debido a que estos organismos son importantes indicadores de la salud ambiental, se considera esencial llevar a cabo más estudios. Por lo tanto, el objetivo del presente estudio fue identificar molecularmente especies de líquenes en la playa “El Maviri”, Sinaloa, México.
Área de estudio
La zona turística “La playa El Maviri” (25°34´47.1 N - 109°6´57.24 O) está localizada en el municipio de Ahome al norte de Sinaloa, entre la Bahía de Topolobampo y el Mar de Cortés, y presenta aproximadamente 2 km de costa. El terreno es plano con la presencia de montañas con elevaciones ligeras. La vegetación del área se compone mayoritariamente de herbáceas, arbustos, chaparrales y vegetación tropical, por ejemplo, mangles y palmas. El tipo de clima es cálido-seco y su temperatura promedio es de 33°C la mayor parte del año (INFAED, 1988).
Toma de muestras
Se llevó a cabo un muestro dirigido durante marzo del 2021 en el que se obtuvieron cinco morfotipos de líquenes. Las muestras se recolectaron de arbustos utilizando un cuchillo para cortar las ramas y fueron transportadas en bolsas de papel al Laboratorio de Biotecnología y Biología Molecular de la Universidad Autónoma de Occidente en Los Mochis, Sinaloa, México. Las muestras se secaron al aire y se almacenaron a 25°C previo a la extracción de ADN. El mapa del área de estudio se muestra en la Figura 1, y las coordenadas de los sitios de muestreo se encuentran en la Cuadro 1.
Figura 1. Mapa del área de estudio. En la imagen se presentan los sitios de muestreo y los nombres correspondientes a cada aislado
Cuadro 1. Número de muestras y coordenadas de los sitios de muestreo. Se muestran las cinco muestras que fueron analizadas con su correspondiente coordenada.
Muestra | Coordenadas |
Lich1 | 25°35´05.30 N - 109°07´33.90 O |
Lich3 | 25°32´07.19 N - 109°07´34.58 O |
Lich4 | 25°32´07.19 N - 109°07´34.58 O |
Lich5 | 25°35´08.41 N - 109°07´33.66 O |
Lich6 | 25°35´9.89 N - 109°07´35.92 O |
Métodos de extracción de ADN y PCR
El ADN genómico se extrajo mediante el método CTAB (Doyle, 1991), en el que se utilizaron 100 mg de cada muestra. Para visualizar la calidad del ADN se realizó una electroforesis en un gel de agarosa al 1% elaborado con Buffer TAE 1X (Tris-actetate-EDTA 0.5 M pH 8.0) y teñido con bromuro de etidio (C21H20BrN3). Las muestras se corrieron a 85V, 25 m/A por 35 min, y se visualizaron en un fotodocumentador Gel DocTM XR (BIORAD). Para la identificación molecular, las regiones ITS fueron amplificadas utilizando el par de cebadores ITS1 (5’-TCC GTA GGT GAA CCT GCG G-3’) e ITS4 (5’-TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC-3’) (Martin y Rygiewicz, 2005). El PCR se llevó a cabo en un termociclador Apollo ATC-201 (Nyx Technik, San Diego, California, EUA). La reacción de PCR constó de un volumen de 25 µL, el cual contenía 1 µL de templado de ADN (1:10), 2.5 µL de solución Buffer 10X, 1 µL de MgCl2 1.5 mM, 0.5 µL de dNTPS 10 mM, 0.5 µL de cada cebador 10 mM, 0.2 µL de Taq ADN Polimerasa (Invitrogen) y 18.8 µl H2O Ultra Pura. Las condiciones para las amplificaciones consistieron de una desnaturalización inicial de 5 min a 95°C, seguido de 35 ciclos de 40 s a 95°C, un alineamiento de 45 s a 57°C, una extensión de 45 s a 72°C, y una extensión final de 5 min a 72°C. Los productos de PCR se separaron mediante electroforesis y se visualizaron de acuerdo a la metodología descrita previamente.
Análisis filogenético
Los productos de PCR se secuenciaron unidireccionalmente en MacroGen Inc, en Seúl, Corea del Sur. Las secuencias de ADN fueron editadas en el programa BioEdit 7.2.5 (Hall, 1999) y los alineamientos se llevaron a cabo con el algoritmo MUSCLE (Edgar, 2004) implementado en el programa Mega 11, utilizando secuencias de referencia de todas las especies reportadas para cada uno de los géneros identificados, así como secuencias de grupos externos para enraizar los filogramas. Las secuencias de referencia fueron recuperadas de Pérez-Ortega et al. (2010), Hayward et al. (2014), Lee y Hur (2020), Rangsiruji et al. (2020), Arup et al. (2023), Li et al. (2023) y Park et al. (2023) (Cuadro 2 en anexo). El árbol filogenético se construyó por el método de Máxima Verosimilitud, utilizando el modelo General Time Reversible con distribución gama (cuatro categorías) y sitios invariantes (GTR + G + I). La topología del árbol se evaluó con 1000 réplicas bootstrap y se editó en FigTree 1.4.0.
En este estudio, cinco hongos liquenizados fueron identificados mediante la amplificación del marcador ITS. El tamaño de los amplicones osciló entre 500 y 600 pb. Las secuencias de los organismos identificados fueron depositadas en la base de datos GenBank (Cuadro 2 en Anexo). Las morfologías observadas durante el muestreo se muestran en la Figura 2. En cuanto a los aislados de Ramalina, la comparación de secuencias en la base de datos GenBank reveló un 96.4% de identidad de los aislados Lich1 y Lich3 con Ramalina complanata y un 95.7% de identidad entre el aislado Lich6 y R. peruviana. Sin embargo, en el análisis filogenético, los aislados Lich1 y Lich3 se agruparon en un cluster independiente con un alto valor de soporte bootstrap (100%), formando un clado hermano con R. complanata, mientras que la cepa Lich6 se agrupó con R. stenospora (MN954853.1) con un alto valor de soporte bootstrap (85%), indicando una cercana relación genética entre las especies (Figura 3).
Figura 2. Líquenes identificados en el presente estudio. A. Ramalina sp. (Lich1 y Lich3) B. Ramalina sp. (Lich6) C. Dirinaria consimilis (Lich4) D. Lecanora sp. (Lich5).
Por otra parte, el aislado Lich4 mostró un 97.1% de identidad con Dirinaria consimilis. Esto se confirmó a través del análisis filogenético, en el que formó un clado con las secuencias de referencia de dicha especie (bootstrap 100%) (Figura 4). En cuanto a Lich5, la comparación de secuencias en la base de datos GenBank reveló un 86.1% de identidad con el orden Lecanorales. En el árbol filogenético, la cepa formó un clado independiente cercano a Lecanora argopholis (bootstrap 100%) (Figura 5). De acuerdo al análisis, Lich1, Lich3 y Lich6 fueron identificados como Ramalina sp., Lich4 como D. consimilis y Lich5 como Lecanora sp.
Los líquenes son conocidos por sus complejas interacciones mutualistas con hongos, algas y cianobacterias (Morillas et al., 2022). Estos organismos se encuentran en diversos hábitats, incluyendo ambientes terrestres, dulceacuícolas y marinos, además, poseen funciones ecológicas importantes, así como contribuir en la formación de suelos y en la fijación de nitrógeno. Adicionalmente, proveen hábitat y nutrición para numerosas especies (Asplund y Wardle, 2016; Grimm et al., 2021; Ellis et al., 2021). Además, los líquenes han sido utilizado para diversos propósitos, incluyendo la producción de tintes, fármacos y sustancias comestibles (Elkhateeb et al., 2021; Shah et al., 2024; Räisänen, 2023).
Figura 3. Árbol filogenético de especies de Ramalina generado a través del Método de Máxima Verosimilitud. La escala representa el número promedio de sustitución por sitio. Se muestran los valores bootstrap ≥50%. Los aislados evaluados se encuentran resaltados y en negritas.
Figura 4. Árbol filogenético de especies de Dirinaria generado a través del Método de Máxima Verosimilitud. La escala representa el número promedio de sustituciones por sitio. Se muestran los valores bootstrap ≥50%. Los aislados evaluados se encuentran resaltados y en negritas.
A pesar del interés creciente en la identificación de líquenes en México, aún existe escaza información sobre el uso de técnicas moleculares, como secuenciación de ADN, para alcanzar una comprensión integral de la diversidad de líquenes en el país. Esta falta de información no sólo impide el progreso del área, sino que afecta el potencial para nuevos descubrimientos. En este estudio, la identificación de cinco hongos liquenizados se logró mediante la amplificación de la región ITS, un acercamiento ampliamente aceptado para la identificación de hongos (Schoch et al., 2012). Este método permite discernir especies genéticamente cercanas y provee valiosas perspectivas sobre sus relaciones evolutivas en comparación con la identificación morfológica y química (Raja et al., 2017; Tekpinar y Kalmer, 2019).
En el presente estudio, tres especímenes de hongos liquenizados recolectados de la playa “El Maviri” fueron identificados como Ramalina sp., dos de ellos, filogenéticamente cercanos a R. complanata (Lich1 y Lich3), y uno cercano a R. stenospora (Lich6). Las especies de Ramalina son reconocidas por su distribución cosmopolita, que incluye costas rocosas, acantilados y zonas de litoral. Este género también se reconoce por incluir especies endémicas o geográficamente específicas (LaGreca et al., 2020; Spjut et al., 2020; Poncet et al., 2021). En México, las especies de Ramalina han sido descritas en distintos estados, así como Baja California (Bowler y Rundel, 1973), Guanajuato (Puy-Alquiza et al., 2018), Morelos (Sánchez-Girón et al., 2023), Puebla (Pérez-Pérez et al., 2024) Sonora (Kashiwadani y Nash, 2002), y Veracruz (Córdova-Chávez, 2016), entre otros. Sin embargo, en el estado de Sinaloa los estudios sobre líquenes son escasos. Entre los pocos reportes disponibles, destaca el conducido por Bowler y Rundel (1972) donde la especie Ramalina sinaloensis fue descrita en el municipio de Elota.
Figura 5. Árbol filogenético de especies de Lecanora generado a través del Método de Máxima Verosimilitud. La escala representa el número de sustituciones promedio por sitio. Se muestran los valores bootstrap ≥50%. Los aislados evaluados se encuentran resaltados y en negritas.
Dirinaria consimilis fue otra especie identificada en este estudio. Ésta es conocida por su habilidad para tolerar condiciones ambientales desfavorables, así como altos niveles de contaminación atmosférica (Shukla et al., 2013). Esta especie ha sido encontrada en zonas urbanas con altos niveles de contaminación, así como en zonas prístinas (Balaji y Hariharan, 2013; Thakur et al., 2022). Esto sugiere que D. consimilis posee adaptaciones únicas que le permite sobrevivir y desarrollarse tanto en ambientes contaminados como no contaminados. En México, las especies de Dirinaria han sido identificadas en distintas zonas, por ejemplo, Chiapas (Sipman y Wolf, 1998), Jalisco (Miranda-González et al., 2023), Puebla (Pérez-Pérez et al., 2024) y Veracruz (Guzmán et al., 2021). Este género también ha sido reportado en las áreas de transición desértica de Baja California, Sonora y Sinaloa (Nash et al., 2002).
Además, Lich5 fue identificado como Lecanora sp., un género caracterizado por incluir a especies de líquenes crustosos descritos en su mayoría en ambientes templados o fríos (Dos Santos et al., 2023). En México, especies de Lecanora han sido reportadas en Aguascalientes (Miguel-Vázquez et al., 2021), Morelos (Sánchez et al., 2023), Oaxaca (León-González y Pérez-Pérez, 2020) y Sonora (Nash y Hertel, 1997).
Por otra parte, los aislados de Ramalina y Lecanora no pudieron ser identificadas hasta la categoría de especie. Esto sugiere que podría haber especies sin descripción dentro del género o que el análisis requiere de diferentes marcadores moleculares para determinar las especies exactas de estos hongos liquenizados. Por ejemplo, algunos estudios han incluido marcadores como mtSSU, LSU, RPB1 y RPB2 para la identificación de especies de Ramalina (Kistenich et al., 2018; LaGreca et al., 2020), así como mtSSU y LSU para especies dentro del género Lecanora (Ivanovich et al., 2021; Park et al., 2022; Li et al., 2023).
En general, la identificación de líquenes es crucial para comprender sus roles ecológicos y sus contribuciones al funcionamiento ecosistémico. Adicionalmente, es importante para los esfuerzos de conservación ya que ciertas especies de podrían ser raras o encontrarse en alguna categoría de riesgo. Por ello, futuras investigaciones deberían enfocarse en desarrollar nuevos métodos para la identificación y caracterización de la diversidad y distribución de estos organismos. El presente trabajo representa el primer reporte de líquenes en esta región y provee datos valiosos para futuras investigaciones. Además, sus hallazgos resaltan la necesidad de realizar más estudios para comprender la importancia ecológica de estos organismos, así como sus interacciones con otros seres vivos en los ecosistemas.
CONCLUSIONES
En este estudio, cinco hongos liquenizados de la playa “El Maviri” en Sinaloa, fueron identificados. Tres especímenes fueron identificados como Ramalina sp., uno como Dirinaria consumilis y otro como Lecanora sp. La información obtenida servirá como base para investigaciones subsecuentes sobre las funciones ecológicas de estos hongos, misma que se considera necesaria para su preservación. Se considera crucial rastrear y examinar a estos organismos para ganar un mayor entendimiento sobre su participación en el mantenimiento de la salud ecosistémica. Este estudio es el primer reporte de identificación molecular de líquenes en el estado de Sinaloa, México.
Contribución de los autores
OGM: Conceptualización del estudio, diseño del muestreo, ejecución del muestreo, análisis e interpretación de datos, preparación del manuscrito, edición y revisión; LIGP: Ejecución del muestreo, análisis e interpretación de datos, preparación del manuscrito; GAMR: Diseño del muestreo, análisis e interpretación de datos, preparación del manuscrito, edición y revisión, aprobación de la versión final del manuscrito; RFG: Análisis e interpretación de datos, preparación del manuscrito, edición y revisión, aprobación de la versión final del manuscrito; KYLM: Diseño del muestreo, análisis e interpretación de datos, preparación del manuscrito, edición y revisión, aprobación de la versión final del manuscrito; LRSP: Análisis e interpretación de datos, preparación del manuscrito, edición y revisión, aprobación de la versión final del manuscrito.
Financiamiento
Este estudio no recibió financiamiento de ninguna organización pública o privada.
Agradecimientos
Los autores agradecen a la Universidad Autónoma de Occidente, en Los Mochis, Sinaloa, por permitir el desarrollo de este proyecto de investigación en sus instalaciones.
Conflicto de interés
Los autores declaran que no hay conflictos de interés.
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ANEXO
Cuadro 2. Secuencias de referencia utilizadas para el análisis filogenético en el presente estudio. Las especies, cepas, país y los números de acceso del GenBank para las secuencias ITS están enlistadas. Los datos de las secuencias obtenidas en el presente estudio se resaltan en negritas.
Especies | Aislado | País | Número de acceso en GenBank |
Dirinaria | |||
D. aegialita | RAMK031278 | Tailandia | MK028196.1 |
D. applanata | Hur 041637 | N/A | EU670217.1 |
D. confluens | Loetberg (UPS L-159685) | Tanzania | OQ866146.1 |
D. consimilis | s.n.-5 | México | OP104860.1 |
D. consimilis | B135-1 | México | OP104847.1 |
D. consimilis | RMG354 | México | OP104844.1 |
D. consimilis | RMG346 | México | OP104857.1 |
D. consimilis | RMG189 | México | OP104858.1 |
D. consimilis | A4-6 | México | OP104845.1 |
D. consimilis | B25-3 | México | OP104842.1 |
D. consimilis | B78-1 | México | OP104840.1 |
D. consimilis | Lich4 | México | PP069828 |
D. leopoldii | A16-3 | México | OP104861.1 |
D. leopoldii | 18-2-3 | México | OP104892.1 |
D. leopoldii | A13-2 | México | OP104873.1 |
D. leopoldii | RMG178 | México | OP104870.1 |
D. picta | RAMK031274 | Tailandia | MK028192.1 |
Dirinaria sp. | Thulin et al. (UPS L-056358) | Somalia | OQ867272.1 |
Lecanora | |||
L. achroa | Papong 6458 F | Tailandia | JN992700.1 |
L. albella | Malicek 7336 | República Checa | KY502423.1 |
L. alboflavida | Coppins | Reino Unido | KY502427.1 |
L. allophana | Malicek 9491 | Finlandia | KY502416.1 |
L. anhuiensis | L1454 | China | OR098679.1 |
L. argentata | Malicek-7 | República Checa | KT630264.1 |
L. argopholis | LYF14-108 | Rusia | MH512978.1 |
L. argopholis | SK C93 | Ucrania | MK672829.1 |
L. argopholis | GN0033 | China | ON159758.1 |
L. austropica | Papong6407 | Tailandia | JQ782706.1 |
L. baekdudaeganensis | BDNA-L-0000065 | Corea | NR_184912.1 |
L. barkmaniana | Malicek-159 | Austria | KT630257.1 |
L. bicincta | eb38 | Austria | AY541263.1 |
L. caesiorubella | Lumbsch 19094a | Australia | JN992710.1 |
L. calendonicola | U1251 | Reino Unido | OQ945702.1 |
L. californica | HTL19914a F | EUA | JQ782707.1 |
L. campestris | U225 | Suiza | DQ787361.1 |
L. careilea | eb70 | Austria | AY541250.1 |
L. carpinea | U507 | Suiza | DQ787364.1 |
L. cenisia | Malicek 5869 | Austria | KY502425.1 |
Continua… | |||
L. chlarotera | U3640 | Países bajos | OQ945709.1 |
L. chlorophaeodes | U210 | Austria | AF159927.1 |
L. cinereofusca | NY1521 | EUA | KP224470.1 |
L. concolor | U266 | Austria | AF070037.1 |
L. confusa | SPO9 | Alemania | GU480120.1 |
L. dispersoareolata | M124 | Austria | AF070016.1 |
L. ecorticata | NMW GBR_:C2015.005.77 | Reino Unido | KT962184.1 |
L. elatinoides | HTL19992d F | Australia | JQ782709.1 |
L. epibryon | m120 | Austria | AF070038.1 |
L. excludens | Palice 21929 | Noruega | MK541647.1 |
L. expallens | JM 9599 | República Checa | MG076968.1 |
L. expersa | Vondrak 12339 | Eslovaquia | KY502452.1 |
L. farinaria | Tonsberg 46170 | Noruega | KY502433.1 |
L. flavopallida | Lumbsch 20031a | Australia | JN987935.1 |
L. flavoviridis | Papong6539 F | Tailandia | JQ782675.1 |
L. formosa | ZX 20129045-2 | China | KT453978.1 |
L. galabrata | U444 | Suiza | OQ945712.1 |
L. gangaleoides | HTL19923a F | EUA | MG554660.1 |
L. helva | HTL19809h F | Fiyi | JQ782713.1 |
L. horiza | u332 | Austria | AY541252.1 |
L. hybocarpa | N/A | EUA | EF105412.1 |
L. impudens | LIFU088-16 | Suiza | KX132996.1 |
L. imshaugii | HTL19273b F | EUA | KT453904.1 |
L. intumescens | Malicek 8480 | República Checa | KY502441.1 |
L. Keniana | 1179E | Kenia | JQ900618.1 |
L. kohu | UNITEC 7497 | Nueva Zelanda | MF116001.1 |
L. layana | NY Lendemer 38131 | EUA | NR_158472.1 |
L. leproplaca | HTL19815r f | Fiyi | JQ782719.1 |
L. leprosa | Papong 6443 F | Tailandia | JQ782720.1 |
L. leptyrodes | eb15 | Austria | AY541255.1 |
L. loekoesii | L1476 | China | OR098694.1 |
L. lojkaeana | jbNoruega | Austria | AY541256.1 |
L. neobarkmaniana | KL19-0111 | Corea del sur | OP099444.1 |
L. orientoafricana | 2205E | Kenia | JQ900619.1 |
L. orosthea | U244 | Austria | AF070035.1 |
L. pacifica | HTL19901c F | EUA | JQ782722.1 |
L. paramerae | N/A | EUA | EF105413.1 |
L. phaeocardia | Papong3473 F | Tailandia | JQ782723.1 |
L. plumosa | Papong6965 F | Tailandia | JQ782726.1 |
L. poliophaea | 4822 | Noruega | MG926178.1 |
L. polytropa | KRAM:Flakus 29565b | Bolivia | OK665617.1 |
L. praesistens | LIFU083-16 | Suiza | KX132991.1 |
L. pringlei | OSC 134697 | EUA | KF024739.1 |
L. pseudogangaleoides subs. verdonii | HTL19103a F | Australia | JQ782727.1 |
L. pseudojaponica | L1424P1 | China | OR098686.1 |
L. pulicaris | Malicek 9484 | Finlandia | KY548052.1 |
L. queenslandica | HTL19113j F | Australia | JQ782728.1 |
Continua… | |||
L. rugosella | N/A | Austria | AY398712.1 |
L. rupicola subsp. Sulphurata | eb71 | Austria | AY541260.1 |
L. salicicola | U3536 | Suiza | OQ945718.1 |
L. saxigena | NY1445 | EUA | KP224466.1 |
L. somervellii | YO10109 | Rusia | MH512979.1 |
L. sorediomarginata | Lsore1 | Portugal | GU480121.1 |
L. stanislai | UGDA-L17315 | Polonia | KY586039.1 |
L. strobilina | LIFU089-16 | Suiza | KX132997.1 |
L. strobilinoides | S3500 | España | MG973238.1 |
L. subcarnea | u274 | Austria | AY541267.1 |
L. subimmergens | Papong 6431 F | Tailandia | JQ782732.1 |
L. subimmersa | HTL19103b F | Australia | JQ782733.1 |
L. substerilis | Malicek-202 | Eslovaquia | KT630254.1 |
L. sulphurea | U212 | Austria | AF070030.1 |
L. swartzii | U178 | Austria | AF070036.1 |
L. symmicta | Daydov 18083 | Rusia | ON553209.1 |
L. thysanophora | 17188 | Polonia | MN387222.1 |
L. toroyensis | Papong 7197 F | Tailandia | JQ782734.1 |
L. tropica | Papong 6440 | Tailandia | JN992714.1 |
L. ussuriensis | KL22-0036 | Corea del sur | OP099452.1 |
L. vainioi | Papong 6957 | Tailandia | JN992716.1 |
L. variolascencs | Malicek 8422 | Austria | KY502445.1 |
Lecanora sp. | Lich5 | México | PP064011 |
Ramalina | |||
R. almquistii | S1 | EUA | MN954826.1 |
R. americana | 1c | EUA | AF109238.1 |
R. asahinae | S5 | México | MN954828.1 |
R. aspera | 06-26100 | China | JF923601 |
R. calicaris | L.S.WangCH050038 | N/A | JF937045.1 |
R. celastri | UNITEC 4617 | Nueva Zelanda | KF583544 |
R. complanata | LMCC 2 | Brasil | FJ356152.1 |
R. complanata | S7 | EUA | MN954829 |
R. conduplicans | 06-26202 | China | JF923600 |
R. confirmata | 06-26195 | China | JF923609 |
R. culbersoniorum | S3 | EUA | MN954827.1 |
R. cuspidata | S32 | EUA | MN954841 |
R. dasypoga | S14 | EUA | MN954831.1 |
R. decipiens | HBG:17046 | Alemania | FJ871078 |
R. europaea | GLM-L 34284 | N/A | KY362397.1 |
R. exilis | TNS:HK:48229 | Japón | AB362790 |
R. farinacea | S17 | Dinamarca | MN954833.1 |
R. farinacea | S16 | Canadá | MN954832.1 |
R. fastigiata | S19 | EUA | U84582.1 |
R. fraxinea | SN066.34/1 | Austria | AY462054.1 |
R. glaucescens | voucher UNITEC 5429 | Nueva Zelanda | KF594455.1 |
Continua… | |||
R. inflexa | voucher UNITEC 5331 | Nueva Zelanda | KF594457.1 |
R. intermedia | intermedia_NC | EUA | MN954836.1 |
R. intermedia intermedia | NC | EUA | AF109239.1 |
R. labiosorediata | Chris Lewis 341a | N/A | KY362421.1 |
R. labiosorediata | S28 | EUA | MN954837.1 |
R. laevigata | 5046 | Brasil | KY171864.1 |
R. leiodea | TNS:YO:5436 | Japón | AB362791 |
R. leptocarpha | S54 | EUA | MN954851.1 |
R. litoralis | TNS:HK:48126A | Japón | AB362792 |
R. mannii | SE-462 | EUA | MG926208.1 |
R. menziesii | 1 | EUA | AF249909.1 |
R. montagnei | N/A | EUA | AF249911.1 |
R. ovalis | UNITEC 4659 | Nueva Zelanda | KF594458.1 |
R. pacifica | HBG:17065 | N/A | FJ871095.1 |
R. paludosa | N/A | EUA | AF109240.1 |
R. panizzei | N/A | EUA | U84584.1 |
R. peruviana | H. Kashiwadani 51490 | Japón | KT698325.1 |
R. pollinaria | TNS:AA:67802 | Japón | AB362794 |
R. roesleri | S29 | Canadá | MN954838.1 |
R. sayreana | S30 | México | MN954839.1 |
R. sekika | TNS:HK:48222A | Japón | AB376966 |
R. semicuspidata | A024 | Japón | MN954814.1 |
R. siliquosa | S31 | Reino Unido | MN954840.1 |
R. sinensis | S21 | EUA | MN954835.1 |
R. sprengeli | 539a | Brasil | KY171868.1 |
R. stenospora | S56 | EUA | MN954853.1 |
R. subbreviuscula | TNS:YO:5926A | Japón | AB362798 |
R. subfarinacea | LG R338 | España | GU827307.1 |
R. subleptocarpha | S55 | EUA | MN954852.1 |
R. subwebbiana | LG R68 | Portugal | GU726333.1 |
R. terebrata | KOPRI L5 | Antártica | EU161239.1 |
R. thrausta | S42 | Canadá | MN954846.1 |
R. unifolia | S59 | EUA | MN954863.1 |
R. usnea | S43 | EUA | MN954847.1 |
R. webbii | LG R73 | España | GU726334.1 |
R. willeyi | s44 | EUA | MN954783.1 |
R. yasudae | TNS:HK:48122A | Japón | AB362799 |
Ramalina sp. | Lich1 | México | PP064008 |
Ramalina sp. | Lich3 | México | PP064009 |
Ramalina sp. | Lich6 | México | PP064010 |
Calicium abietinum (Outgroup) | MP40 | N/A | KX512872.1 |
Ramboldia stuartii (Outgroup) | Elix 28664 F | Australia | EU075549.1 |
Usnea articulata (Outgroup) | articulata_01 | JN086277.1 | |